Live API
Sequence Operations
從公開來源抓 protein / gene sequence，落到 Postgres 快取後，前端就能直接搜尋、篩選、檢視與刪除。
UniProt / Ensembl 同步
Render DB 快取
前端即時讀取
Product Surfaces
三個可驗證的核心模組
每一個模組都能直接追到後端 API、DB 快取或 RAG 文件輸出。
可驗證架構設計
Live API
Knowledge Vault
把 UniProt annotation 與 PubMed 摘要整成 evidence feed，再輸出可直接送進向量資料庫的 RAG 文件片段。
Evidence Search
Document Chunking
Metadata-ready
Live API
RAG Documents
把知識庫中的 annotation 與 literature 整理成 chunk 與 metadata，前端可以直接預覽後端輸出的檢索文件格式。
Chunk Preview
Source Metadata
Retrieval-ready
Runtime Status
全部 API-backed，即時可驗證
序列同步、知識同步，以及 RAG 文件輸出，每一塊都能對應到真實端點與資料結構。
真實資料驅動
Sequence Vault
Live API-backed真的會讀 `/healthz`、`/api/sequences/summary`、`/api/sequences`，也能同步與刪除 DB 紀錄。
Knowledge Vault
Live API-backed真的會同步知識資料、讀取快取，並向 `/api/rag/documents` 產生 RAG 文件預覽。
RAG Documents
Live API-backed會向 `/api/rag/documents` 讀取後端整理好的 chunk 與 metadata，直接預覽檢索文件輸出。
Live Modules
資料同步、證據檢索與 RAG 輸出
Sequence Vault 與 Knowledge Vault 負責建庫，RAG preview 負責把後端文件輸出直接攤在 UI 上檢查。
Live Interface · Data Cache
把公開蛋白質與基因序列爬進 DB，直接在平台內動態展示
這個模組會從 UniProt 與 Ensembl 抓取 protein / gene sequence，寫進 Render PostgreSQL，之後頁面就直接從 DB 讀快取，不再只是靜態示範卡片。
Live API · UniProt + Ensembl + Render Postgres
Render Sequence Cache
切換 protein / gene cache，查看最新入庫紀錄與來源 metadata。
DB-backed Interactive Feed
Sequence Detail
尚未選取資料列。
Live Interface · ENA Metadata Cache
把 ENA sequencing run metadata 收進 DB，直接查 study / sample / instrument
這個模組會從 ENA Portal API 抓取 sequencing run metadata，寫進 Render PostgreSQL，之後頁面就能直接查詢 study accession、sample accession、library strategy、instrument model 與 FASTQ metadata。
Live API · ENA Portal API + Render Postgres
Sequencing Run Cache
查看 ENA run metadata、library strategy 與 instrument 分布，直接驗證資料有沒有正確落進 DB。
Study + Sample + Run Metadata
Sequencing Run Detail
尚未選取 sequencing run 紀錄。
Live Interface · Evidence Cache
把 UniProt 註釋與 PubMed 摘要整理成可查詢、可匯出的知識庫
這個模組把蛋白質功能註釋和 NCBI 文獻摘要存進 Render PostgreSQL，再整理成 RAG-ready documents。前端可直接搜尋證據，後端可直接輸出 chunk 與 metadata 給檢索流程。
Live API · UniProt + NCBI E-utilities + RAG-ready
Knowledge Search Surface
切換 protein annotation / literature，查看 DB 快取與對應的 RAG chunk 預覽。
Search + Evidence + Documents
Knowledge Detail
尚未選取知識紀錄。
RAG-ready Documents
這裡顯示的是後端整理好的 chunk 與 metadata，可直接餵進向量資料庫或檢索流程。
尚未產生文件預覽。
目前還沒有 RAG 文件預覽。先同步知識資料或按「更新 RAG 預覽」。
Current Scope
資料同步、證據檢索與 RAG 輸出
三個核心模組完整串接，序列、知識與文件層一起可用。
Protein Network
蛋白質交互作用網路
STRING DB 真實數據，可拖曳、縮放。