Standalone Interactive Lab · Protein Design × Structure Preview

ProteinMPNN 互動展示

序列設計、PDB 結構預覽、ESMFold 與簡化 Rosetta 評分,集中在同一個操作面。

Browser-side sampling RCSB / ESMFold structure Rosetta-style scoring

把設計、搜尋與結構預覽放在同一頁

這個工作台適合快速展示逆折疊設計流程:先用序列或 preset 啟動設計,再即時比對結構、切換著色模式,最後用簡化能量分數做初步排序。

01

輸入序列

支援 preset、手動輸入與固定殘基區段,直接模擬 ProteinMPNN 的設計約束。

02

載入結構

可手動輸入 PDB ID,或讓系統嘗試從相似序列與資料庫快取自動配對。

03

檢視結果

檢查多條設計序列、突變位置與 Rosetta 近似分數,快速做第一輪比較。

What This Page Keeps
  • 保留首頁原本的互動設計體驗,不需要跳回首頁捲動操作。
  • 結構視窗與結果表格同頁,分享連結時脈絡更完整。
  • 後續若要加 API proxy、快取或更多模型,不會再讓首頁過重。

直接操作 ProteinMPNN 工作台

以下保留完整互動區塊,包含序列設計、3D 結構預覽、突變著色與 Rosetta 簡化評分。

⚙ 輸入參數
0 殘基
110
低溫 (保守)高溫 (多樣)
邊緣數 48,偏差 0.2Å — 標準精確度模型(論文推薦)
ESM-2 facebook/esm2_t6_8M_UR50D · 後端代理 · 無需設定
🔬 蛋白質 3D 結構預覽
🔬
輸入 PDB ID 或點擊下方標籤載入結構
支援任意公開 PDB 檔案 · 3Dmol.js 渲染引擎
📊 設計結果
🧬
設定參數後點擊「設計序列」
ProteinMPNN 演算法將在瀏覽器中即時執行
基於 BLOSUM62 × 溫度控制 Softmax 取樣